Để khắc phục được vấn đề hiện tại trên chương trình MISA SME.NET 2015 chứng từ chuyển kho nếu TK Nợ & TK Có cùng 1 tài khoản thì chương trình vẫn được ghi trên Sổ Cái để đảm bảo so sánh số phát sinh giữa Sổ Kho và Sổ Cái luôn khớp nhau dẫn đến số phát sinh của TK kho tăng lên & khi đối chiếu số liệu giữa MISA SME.NET 2012 & MISA SME.NET 2015 không khớp nhau.
Kể từ phiên bản R4 trở đi, đối với chứng từ chuyển kho mà TK Nợ và TK Có là cùng 1 TK thì không ghi lên Sổ cái mà chỉ ghi lên Sổ kho
Đối với Báo cáo đối chiếu sổ kho và sổ cái, phần mềm MISA SME.NET 2015 sẽ bổ sung tùy chọn "Lấy chứng từ chuyển kho hạch toán cùng TK Nợ/Có lên số liệu theo sổ kho"
•Ngầm định không tích chọn mục này
•Nếu tích chọn mục này thì trên báo cáo cột số liệu theo sổ kho lấy cả phát sinh của chứng từ chuyển kho có cùng TK Nợ/Có
•Nếu không tích chọn mục này thì trên báo cáo cột số liệu theo sổ kho không lấy phát sinh của chứng từ chuyển kho có cùng TK Nợ/Có